Le livre s'ouvre par une réunion de Mangemorts dans le manoir de Lucius Malefoy, à laquelle assistent Rogue ainsi qu'un fonctionnaire du ministère nommé Yaxley. Cette réunion a pour but de mettre au point un plan pour tuer Harry Potter lors de son transfert vers un lieu plus sûr, puisque le charme de protection dont il bénéficie en habitant chez sa tante et son oncle, les Dursley, va prendre fin lors de son 17e anniversaire. À cette fin, Voldemort réclame la baguette de Lucius Malefoy, car il a remarqué les étranges phénomènes qui lient sa propre baguette à celle d'Harry. On sent également que Voldemort n'a toujours pas pardonné aux Malefoy leurs échecs et se plaît à les humilier.
Après que les Dursley ont été escortés en lieu sûr par des sorciers, et que Dudley a exprimé son respect et sa gratitude envers un Harry plutôt surpris, plusieurs membres de l'Ordre du Phénix se rendent au 4 Privet Drive pour emmener Harry. Le plan consiste à donner à six membres de l'Ordre du Phénix (Mondingus Fletcher, Ron, Hermione, Fleur, Fred et George Weasley) l'apparence de Harry grâce à une potion de Polynectar et à faire escorter chacun d'entre eux par un membre plus expérimenté. Tous devront conduire leur « Harry » dans un lieu différent où un Portoloin leur permettra de se rendre au Terrier, la demeure des Weasley. Hélas, l'heure du transfert étant connue de Voldemort grâce aux informations de Rogue, des mangemorts s'attaquent aux différents groupes dès leur départ. Pendant la bataille qui s'ensuit, George Weasley perd une oreille à cause de Rogue qui lui jette un sort de Sectumsempra ; Hedwige, la chouette de Harry, est tuée par un Avada Kedavra qui visait Hagrid ; Alastor Maugrey, dit Fol-Œil, est tué par Voldemort. Le vrai Harry est identifié lorsqu'il lance un Expelliarmus contre Stan Rocade. Voldemort se lance à sa poursuite mais échoue à nouveau à le tuer lorsque la baguette d'Harry, semblant agir de son propre vouloir, retourne le sort de l'assaillant et détruit la baguette de Lucius Malefoy. Après une course folle, Harry, atteint la maison des parents de Tonks, où Voldemort ne peut le suivre à cause des protections dont l'habitation fait l'objet. De là, ils rejoignent les autres survivants au Terrier grâce au Portoloin. Une fois au Terrier, Harry, Ron et Hermione commencent à penser aux Horcruxes. Les horcruxes sont des objets chers à Voldemort dans lesquels ce dernier a placé des fragments de sa propre âme, ce qui est censé le rendre immortel. Les trois jeunes sorciers sont désormais fermement décidés à quitter Poudlard pour se consacrer pleinement à la quête confiée par Dumbledore.
Quelques jours plus tard, le nouveau ministre de la Magie, Rufus Scrimgeour, arrive au Terrier pour leur donner les legs que Dumbledore leur a réservés : Ron reçoit le Déluminateur de Dumbledore, objet qui possède le pouvoir de capturer les lumières, Hermione reçoit Les contes de Beedle le Barde, un livre d’histoires pour enfants écrites en runes antiques; Harry a hérité de l’épée de Godric Gryffondor et du Vif d'or qu’il avait attrapé lors de son premier match de Quidditch. Néanmoins, le ministère refuse de lui donner l'épée, prétextant que celle-ci n'a jamais vraiment appartenu à Dumbledore. Les trois jeunes sorciers décident alors de partir à la recherche des Horcruxes après les noces de Bill et Fleur.
À la réception du mariage, le Patronus de Kingsley (un lynx) vient informer les Weasley que le Ministère de la Magie est tombé et le ministre est mort. Une attaque de mangemorts étant imminente, Harry, Ron et Hermione transplanent à Londres, sur Tottenham Court Road, et se retrouvent d’abord dans un café moldu. Harry, sous la cape d’invisibilité, aperçoit alors deux mangemorts assis à côté d’eux. Une courte bataille s'engage et les trois jeunes gens transplanent au 12 Square Grimmaurd. Dans les jours qui suivent, le trio découvre par hasard l’identité de R.A.B : il s’agit de Regulus Arcturus Black, le frère de Sirius, ancien mangemort depuis longtemps décédé. Harry interroge alors Kreattur sur l’histoire de son ancien maître. L’elfe de maison raconte que Voldemort avait demandé à Regulus de lui prêter son elfe afin d’accomplir une mission, qui n’était autre que de cacher le médaillon de Serpentard dans une grotte. Après avoir bu tout le poison, Kreattur, sur le point de mourir avait transplané chez les Black suivant ainsi l'ordre de son maître de revenir. De là, il l'avait informé sur les agissements du Seigneur des Ténèbres, et Regulus repartit à la recherche de l’Horcruxe avec l’elfe de maison. Mais contrairement à Voldemort, il avait décidé de boire lui-même le poison et finit noyé dans le lac par les Inferi après avoir confié à Kreattur la tâche d’échanger le médaillon et de détruire le véritable. Toutefois Kreattur n’a jamais réussi à le faire et informe Harry, Ron et Hermione que Mondingus Fletcher a fini par le voler. Fletcher, attrapé par Kreattur sur les ordres de Harry, indique à contrecœur que Dolores Ombrage lui a confisqué le médaillon. Sur les conseils d'Hermione, Harry se réconcilie peu à peu avec l'elfe en lui donnant le faux médaillon et en lui disant qu'il lui revenait de droit.
La recherche des Horcruxes
Durant leur séjour au 12 Square Grimmaurd, ils apprennent que Voldemort a installé un ministre fantoche et fait rechercher Harry comme assassin présumé de Dumbledore. Rogue est devenu Directeur de Poudlard et des Mangemorts (les frères et soeurs Carrow) sont devenus professeurs. Ils reçoivent également Lupin, qui propose de se joindre à eux. Mais Harry refuse de manière violente (il traite Lupin de lâche) pour une bonne raison : Lupin est marié à Tonks depuis peu, et ils attendent un bébé. Parallèlement, Harry fait de nombreux rêves où il remarque que Voldemort recherche des fabricants de Baguette (Ollivander, Gregorovitch) pour trouver une solution contre celle de Harry.
Après un mois d’espionnage envers un ministère de la Magie maintenant le siège d'un régime de terreur qui exclut tous les sorciers nés Moldus, Harry, Ron et Hermione tentent d'y pénétrer, espérant que Dolores Ombrage ait le médaillon de Serpentard sur elle au ministère. À cet effet, ils utilisent à nouveau le polynectar et retrouvent Ombrage alors qu’elle interroge des sorciers nés de parents moldus. Ils réussissent à récupérer l’Horcruxe. Toutefois, la cachette du 12 square Grimmaurd est découverte lors de leur retour. Le trio est donc contraint de fuir et se met à vagabonder dans la campagne anglaise, car ils sont maintenant recherchés.
Alors qu'ils sont cachés, ils surprennent une conversation entre plusieurs proscrits, dont Dean Thomas, Ted Tonks et deux gobelins, qui leur révèle que Dumbledore a joué un tour au Ministère : il a subtilisé l'épée de Gryffondor avec une copie et a caché la vraie. Le lieu où se trouve la véritable épée reste complètement inconnu. Phineas Nigellus, dont le trio a emporté le portait du square Grimmaud car il en existe un double dans le bureau du directeur de Poudlard, leur dévoile que Dumbledore a utilisé l'épée afin de briser la bague des Gaunt.
L'épée a donc le pouvoir de détruire les Horcruxes : le trio décide de mettre la main dessus afin de détruire le médaillon récupéré, d'autant plus que celui-ci semble avoir une emprise néfaste (mauvaise humeur, agressivité) sur celui qui le porte, notamment Ron. À la suite d'une énième dispute, ce dernier transplane en abandonnant ses deux camarades. Harry et Hermione décident d'aller à Godric's Hollow -le village de naissance de Harry et de vie de Dumbledore- en espérant que Dumbledore y ait laissé l’épée.
Arrivés à Godric’s Hollow, Harry et Hermione se rendent au cimetière pour y chercher des indices. Ils découvrent la tombe des parents de Harry, ainsi que celles de la mère et de la sœur d’Albus Dumbledore. Ils rencontrent Bathilda Tourdesac, une vieille amie de famille de Dumbledore qui a écrit Histoire de la magie. Pensant que Dumbledore a pu lui confier l'épée, ils la suivent chez elle. Malheureusement, Bathilda a été assassinée et son corps est en fait habité par Nagini, le serpent de Voldemort. Après un combat contre le serpent, durant lequel Hermione brise accidentellement la baguette magique de Harry, ils s'enfuient et échappent de peu à Voldemort. Au passage, Harry revit intégralement l'assassinat de ses parents tel que se le rappelle Voldemort.
Ils doivent donc se cacher à nouveau dans les forêts anglaises. C'est alors qu'un Patronus en forme de biche apparaît tout près de leur campement au tour de garde de Harry et guide celui-ci jusqu'à la véritable épée de Godric Gryffondor, cachée dans un lac gelé de la forêt. Harry plonge pour la récupérer, mais le médaillon de Serpentard, qu’il porte autour du cou, se comporte bizarrement à l'approche de l'épée et essaie de l'étrangler. Ron arrive au bon moment pour sauver Harry de la noyade, et sort l'épée de l'eau. Harry ouvre le médaillon grâce au Fourchelang, et laisse à Ron l'honneur de le détruire. Mais une voix surgit de l'Horcruxe : elle se sert des craintes les plus sombres de Ron pour le mettre à l'épreuve. Malgré tout, Ron trouve la force de frapper et de détruire l'Horcruxe. De retour sous la tente, Ron explique à Harry et Hermione qu'il a voulu revenir dès la seconde suivant son départ, mais qu'il n'a pas pu les retrouver avant, du fait des sortilèges de protection dont ils s'entourent. Il découvre aussi que le Déluminateur ne sert pas qu'à éteindre les lumières : il lui a montré le chemin pour les retrouver. Ron leur explique également que le nom de Voldemort est devenu tabou, c'est-à-dire qu'il est marqué et que les Mangemorts peuvent localiser quiconque le prononce. C'est de cette manière qu'ils ont été localisés à Tottenham Court Road.
La prochaine étape de leur périple consiste à se rendre auprès de Xenophilius Lovegood, le père de leur amie Luna, pour en savoir plus sur la marque de Grindelwald, un symbole apparaissant dans le livre que Dumbledore a légué à Hermione, et qu'ils ont vu à plusieurs occasions pendant leur voyage.
Les Reliques de la Mort
Harry, Hermione et Ron arrivent à la maison de M. Lovegood, qui leur apprend que le symbole est celui des Reliques de la Mort, trois objets particulièrement puissants : une baguette magique dite « Baguette de Sureau », une pierre dite « Pierre de Résurrection », et une cape, la « Cape d’Invisibilité ». Harry prend conscience que la cape qui lui vient de son père est une des trois reliques.
Selon la légende racontée dans le livre d’Hermione, trois frères arrivèrent au bord d'une rivière et firent apparaître un pont pour la traverser. Au milieu du pont, ils rencontrèrent la Mort elle-même. Celle-ci enrageait à l'idée que ces hommes puissent traverser sans périr. Imaginant alors un plan machiavélique pour les faire mourir quand même, elle offrit un cadeau à chacun. Le plus vieux des frères, combatif, demanda une baguette, si puissante qu'elle ne pourrait jamais perdre. Alors, la Mort prit une branche de Sureau et lui tailla la Baguette de Sureau. Le deuxième frère, arrogant, voulut humilier la Mort encore plus, et lui demanda le pouvoir de ramener les morts à la vie. La Mort prit une pierre près de la rivière, la lui remit, et affirma qu'il était maintenant en possession de la Pierre de Résurrection. Le plus jeune, humble et rusé, ne faisant aucunement confiance à la Mort, lui demanda un objet qui lui permettrait de se déplacer sans être vu d'elle. La Mort lui offrit sa cape. Les trois frères se séparèrent pour vivre chacun leur vie. Le plus vieux provoqua de nombreux duels, se vantant que son pouvoir lui venait de sa baguette imbattable, donnée par la Mort elle-même. Une nuit, un sorcier jaloux lui trancha la gorge dans son sommeil et vola la baguette. Le deuxième vivait seul chez lui. Il tourna la Pierre de Résurrection trois fois dans ses mains et fît revivre la femme qu'il aimait, décédée avant le mariage. Malheureusement, elle appartenait toujours aux royaume des morts et n'était qu'une âme en peine. Fou de douleur, il se suicida pour la rejoindre. La Mort chercha alors longtemps le plus jeune frère, mais sans jamais le trouver. Celui-ci, au crépuscule de sa vie, légua la cape d'invisibilité à son fils, salua la Mort comme une amie, et finalement l'accompagna en son royaume.
Xenophilius, après avoir narré cette histoire, trahit les trois sorciers en les dénonçant au ministère dans l'espoir que sa fille Luna, prise en otage par les Mangemorts, soit libérée. Harry, Ron et Hermione parviennent néanmoins à échapper aux Mangemorts grâce à la cape d'invisibilité. Harry pense alors qu'ils doivent rassembler les « Reliques de la Mort » afin de défaire Voldemort.
Plus tard, alors qu’ils campent à nouveau dans les bois, ils parviennent à obtenir des nouvelles du ministère et du monde des sorciers par une émission de radio clandestine, Potterveille. Les émissions sont animées par Lee Jordan, Kingsley Shacklebolt, les jumeaux Weasley et Remus Lupin. Ils apprennent que Ted Tonks est mort. Le même jour, Harry prononce machinalement le nom de Voldemort. Un groupe de Rafleurs, menés par Greyback, apparaît soudainement autour d’eux et les attrapent tous les trois. Les Rafleurs réalisent qu'ils détiennent Harry Potter, désormais « Indésirable Numéro 1 » dont la capture est récompensée par la somme de 200 000 Gallions d’or. Les Rafleurs emmènent alors le trio au manoir des Malefoy, le quartier général des Mangemorts.
Dans le manoir des Malefoy, Harry et Ron sont emprisonnés dans un cachot avec d'autres captifs, alors qu’Hermione est torturée par Bellatrix Lestrange. Désespéré, Harry lance un appel au secours en utilisant le miroir légué par Sirius, dans lequel il aperçoit une nouvelle fois un regard bleu qu'il pense être celui d'Albus Dumbledore. Dobby apparaît alors et libère Dean Thomas, ancien élève de Poudlard, un gobelin du nom de Gripsec, Ollivander le fabricant de baguettes qui a disparu depuis plus d'un an, ainsi que Luna Lovegood. Mais le bruit de son apparition alerte les Mangemorts qui se trouvent au-dessus des cachots. Ils envoient Peter Pettigrow pour vérifier ce qui se passe. Pettigrow hésite à tuer Harry, car il lui est redevable de sa propre survie. Puni à cause de sa trahison, Pettigrow est étranglé par sa main magique, façonnée par Voldemort trois ans plus tôt dans le cimetière.
Ron prend la baguette magique de Peter et se précipite en haut avec Harry, où ils combattent les Mangemorts jusqu'à ce que Dobby fasse tomber un lustre juste à côté de Bellatrix. Dans le chaos, Harry désarme Bellatrix, puis Drago Malefoy et s'empare de leurs baguettes. Avec Ron, il libère Hermione et tous transplanent chez Bill et Fleur dans leur maison au bord de la plage. Malheureusement, Bellatrix a blessé mortellement Dobby en lui lançant son couteau au moment où il quittait le Manoir.
Harry offre un digne enterrement à Dobby, puis grave sur une pierre : « Ci-gît Dobby, elfe libre ». Au cours des semaines qui suivent, Harry, Ron et Hermione complotent avec Gripsec pour pénétrer par effraction dans la chambre forte de la famille Lestrange, chez Gringotts. En effet, pendant l'interrogatoire chez les Malefoy, Harry a noté la terreur de Bellatrix à la vue de l’épée de Gryffondor, qui était censée se trouver dans son coffre. Il pense donc qu’un Horcruxe est caché dans ce dernier. Gripsec veut bien aider les trois sorciers à condition que lui soit rendue l'épée de Gryffondor, créée par les Gobelins. Harry accepte, cependant il ne précise pas quand il rendra l’épée. Bill, ne sachant rien des plans qu'ils préparent entre eux, avertit néanmoins Harry sur la façon dont Gripsec pourrait interpréter une promesse faite par un humain.
Gripsec, Harry, Ron et Hermione parviennent à pénétrer dans la chambre forte des Lestrange, dont le contenu a subi un sort qui rend tout objet brûlant à celui qui le touche sans autorisation, et le fait se multiplier. Harry saisit néanmoins la coupe d’Helga Poufsouffle, que Voldemort a transformé en Horcruxe, en passant la pointe de l'épée de Gryffondor dans l’une des anses. Mais Gripsec les trahit et s'empare de l'épée. Harry, Ron et Hermione réussissent à sortir de la chambre et s’échappent de Gringotts sur le dos du dragon aveugle censé garder le coffre des Lestrange.
Voldemort réalise alors que Harry et ses amis sont à la recherche des Horcruxes et qu’ils tentent de les détruire. Il part donc vérifier une à une ses cachettes et se rend compte que deux Horcruxes ont déjà disparu. Grâce au lien télépathique qui le lie à Harry, il indique accidentellement à celui-ci où trouver le dernier Horcruxe : à Poudlard.
La Bataille de Poudlard
En arrivant à Pré-au-Lard, le trio est sauvé des sentinelles mangemorts par le tenancier de la Tête de Sanglier. Harry se rend compte que c'est son regard bleu qu'il a aperçu dans son fragment de miroir et l'identifie grace au fragment de miroir, sous le portrait d'Ariana : le tenancier n'est autre qu'Abelforth Dumbledore, le frère d'Albus Dumbledore. C'est lui qui a envoyé Dobby les sauver. Abelforth ouvre alors un passage secret vers Poudlard, par lequel Neville Londubat vient les rejoindre. Le passage mène à la Salle sur Demande, où Neville, à la tête de l'Armée de Dumbledore reconstituée, s'est retranché. Il leur explique que l'école a changé du tout au tout, que la magie noire est maintenant enseignée et les élèves récalcitrants fréquemment torturés. Neville rappelle tous leurs amis dispersés, anciens élèves et même l'Ordre du Phénix, qui débarquent les uns après les autres par le même passage.
Harry a l'intuition que le dernier Horcruxe est le diadème perdu de Rowena Serdaigle. Guidé par Luna, il file à la salle commune des Serdaigle pour essayer d'en savoir plus. Là, ils tombent sur les Carrow mais parviennent à les neutraliser. Harry sent que Voldemort est en chemin vers le château et prévient Minerva McGonagall, qui, elle-même, avertit les autres directeurs de maisons. Les élèves encore mineurs sont évacués par M. Rusard et Mme Pomfresh, ainsi que toute la maison Serpentard, alors que les élèves majeurs sont autorisés à rester pour combattre s’ils le souhaitent. Voldemort arrive et lance ses mangemorts, ainsi que deux géants, à l'assaut du château.
Pendant ce temps, Harry part à la recherche du diadème, qui est perdu depuis des siècles. La Dame Grise, le Fantôme de Serdaigle, accepte de renseigner Harry et lui apprend qu'elle n'est autre que la fille de Rowena Serdaigle, à qui en son temps elle avait volé l'objet avant de s'enfuir en Albanie et de l'y cacher dans l'arbre creux d'une forêt. Harry réalise alors que Voldemort a certainement caché le diadème sur le chemin du bureau de Dumbledore le soir où il est venu demander un poste d'enseignant. Il se rappelle subitement que le jour où il avait lui-même caché son livre de potions (voir Harry Potter et le Prince de sang-mêlé) dans la Salle sur demande, il avait marqué la cachette avec une vieille tiare. C'était le diadème.
De son côté, Ron a eu la brillante idée de pénétrer avec Hermione dans la Chambre des Secrets afin d'y prendre des crochets encore envenimés du Basilic (voir Harry Potter et la Chambre des secrets) avec lesquels Hermione a pu détruire la coupe de Poufsouffle. Lorsque Ron prend l'initiative d'aller mettre à l'abri les elfes de maison, Hermione se jette sur lui et l'embrasse. Puis le trio se rend à la Salle sur demande, où il retrouve Drago Malefoy, Vincent Crabbe et Gregory Goyle. Crabbe utilise un sort de feu extrêmement puissant, le Feudeymon, qui incendie le contenu de la salle. Harry et ses amis parviennent à s'échapper sur deux balais, récupérant le diadème et sauvant Malefoy et Goyle. Crabbe ne parvient pas à s'échapper et est tué par son propre feu, qui détruit également le diadème. En effet, comme l'explique Hermione, le Feudeymon est une des substances qui détruisent les Horcruxes. C’était le dernier objet transformé en Horcruxe; il ne reste plus que le serpent de Voldemort, Nagini.
Après avoir eu une autre vision au travers des yeux de Voldemort, Harry mène ses amis à la Cabane Hurlante. Là, ils assistent à l'assassinat de Severus Rogue, tué par Nagini sur ordre de Voldemort. En effet, Voldemort a découvert que Dumbledore était le seul propriétaire de la Baguette de Sureau. Après avoir profané sa tombe pour la retrouver, mais constatant que le pouvoir de la baguette ne lui appartient pas, il pense pouvoir l’acquérir en tuant son dernier propriétaire. Rogue, ayant tué Dumbledore, devrait être ce propriétaire. Voldemort parti, le professeur mourant confie des souvenirs à Harry qui les recueille dans une fiole. Dans un ultime effort, Rogue demande alors à Harry de le regarder dans les yeux et expire quelques secondes plus tard.
De retour au château, Harry aperçoit dans la Grande Salle Fred Weasley, Remus Lupin, Nymphadora Tonks et Colin Crivey parmi les victimes de la bataille. Abattu par leurs morts et pressé par l'ultimatum d'une heure que Voldemort lui a lancé, il se dirige vers le bureau de Dumbledore pour utiliser la Pensine. Il découvre alors que Rogue était du côté de Dumbledore depuis longtemps, motivé par son amour de toujours pour Lily Evans, la mère de Harry. Rogue et Lily se connaissaient depuis l'enfance. Mais à la fin de leur scolarité à Poudlard, Rogue avait suivi la voie des Mangemorts et Lily s'était détournée de lui. Ayant réalisé que la prophétie qu'il avait livrée à Voldemort visait le fils de Lily, il avait offert ses services à Dumbledore pour la protéger. Suite à l'assassinat de Lily, Rogue avait promis de protéger Harry à tout moment, au nom de son amour pour elle et pour se racheter. Harry apprend aussi que c’est Dumbledore qui avait demandé à Rogue de le tuer. Il était en effet condamné à mourir rapidement à cause du maléfice de la bague qui lui avait brûlé la main (voir tome 6). Rogue se montrerait ainsi plus convaincant auprès de Voldemort, et pourrait continuer à infiltrer les rangs des Mangemorts et être nommé Directeur de Poudlard, pour protéger l'école et ses élèves. Dumbledore avait aussi confié à Rogue que Voldemort a transformé accidentellement Harry en Horcruxe, ce qui explique les visions de Harry et sa capacité à parler le Fourchelang. Voldemort ne peut pas être vaincu tant que Harry est vivant. Dumbledore avait même demandé à Rogue de s'arranger pour que l'Ordre eût l'idée d'utiliser du polynectar lors du transfert de Harry. C'était lui aussi qui avait envoyé le Patronus en forme de biche, le même que celui de Lily, et qui avait guidé Harry jusqu’à l'Épée de Gryffondor.
Ébranlé mais résigné face à sa destinée, Harry se dirige vers la forêt interdite, où Voldemort l'attend entouré de ses Mangemorts. En sortant du château, il rencontre Neville et l'informe que le serpent Nagini doit être tué à tout prix.
Réalisant que sa mort prochaine correspond à « la fin » décrite dans l'énigme du Vif d’or que lui a laissé Dumbledore, Harry le porte à sa bouche et murmure : « je suis sur le point de mourir ». Le Vif d’or s'ouvre pour faire apparaître la pierre de Résurrection. Harry utilise alors la pierre pour retrouver les esprits de ses parents, de son parrain, Sirius Black, et de Rémus Lupin, qui le suivent et restent à ses côtés, le soutenant et le protégeant contre l'armée de détraqueurs qui errent dans la forêt, tandis qu’il approche de Voldemort, caché sous sa cape d’invisibilité.
Arrivé auprès de Voldemort, Harry laisse tomber la pierre et range sa cape révélant sa présence. Prêt à mourir sans se défendre ni bouger, il permet à Voldemort de lui lancer le sortilège de l’Avada Kedavra. Il se retrouve alors dans ce qui semble être la gare (vide et blanche) de King's Cross à Londres. Dans ce lieu, Harry retrouve Albus Dumbledore, qui explique qu'en utilisant le sang de Harry pour recréer son corps, Voldemort a transféré lui-même une partie du charme de protection de Lily en lui. Par conséquent, tant que ce charme est présent dans le corps de Voldemort, tant que Voldemort existe, Harry ne peut pas mourir. Il lui explique aussi qu'il est digne de posséder les Reliques de la Mort car il les souhaite dans un but noble et courageux (à l'inverse de lui-même, qui les avait trouvées, mais, à part la Baguette de Sureau, pas méritées). Le véritable maître de la Mort est celui qui l'accepte et accepte l'idée de mourir. Harry a le choix entre « laisser la mort venir » ou continuer de vivre et d'arrêter Voldemort. Il choisit la vie.
Dans la forêt, Voldemort a été projeté en l'air par l'Avada Kedavra qu'il a lancé à Harry. Méfiant, il envoie Narcissa Malefoy vérifier l'état de santé de Harry . Détectant que celui-ci est en vie, elle s'assure que Drago va bien avant de mentir à Voldemort sur la mort de Harry, son seul but étant de retrouver son fils. Sur les ordres de Voldemort, Hagrid porte Harry (qui se fait passer pour mort) à Poudlard comme trophée. Neville Londubat fait bravement face à Voldemort, et refuse de le rejoindre. Comme punition, Voldemort l'encagoule avec le Choixpeau et l’enflamme. À ce moment des renforts arrivent : les familles des étudiants et les habitants du village ameutés par Charlie Weasley et Horace Slughorn, les centaures, les sombrals, Buck l'Hippogriffe et les Elfes de Maison dirigés par Kreattur viennent se joindre aux professeurs de Poudlard, aux membres de l’Ordre ainsi qu'aux étudiants restés pour se battre. On assiste à une gigantesque bataille. Dans la confusion, Harry parvient à se couvrir de sa cape d’invisibilité pour « disparaître ». L'épée de Godric Gryffondor apparait sous le Choixpeau car Neville a fait preuve de courage en faisant face à Voldemort, et il tire alors l'épée pour trancher la tête de Nagini, détruisant le dernier des Horcruxes, comme Harry le lui avait demandé.
La bataille continue dans le château et particulièrement dans la grande salle. Bellatrix Lestrange ayant tenté de s’en prendre à Ginny, Molly Weasley l'affronte en combat singulier et la tue. Harry se révèle alors face à Voldemort, le provoque et l'humilie devant tous en l'appellant par son nom original, Jedusor, qu’il a depuis longtemps renié, et en lui expliquant ses multiples erreurs. En laissant Voldemort le tuer dans la forêt, Harry a protégé ses proches comme l'avait fait sa mère pour lui : Voldemort est à présent incapable de tuer d'où la survie de Neville.
Voldemort tente à nouveau de le tuer mais comme le lui explique Harry, la Baguette de Sureau ne lui appartient pas et son pouvoir n’est pas à lui, bien qu’il ait tué Rogue. Puisque Rogue n'a tué Dumbledore que sur les ordres de ce dernier, il n'a jamais été maître de la baguette. C'est Drago Malefoy qui, ayant désarmé Dumbledore en haut de la tour d’astronomie, en était le maître. Cependant, Harry ayant à son tour désarmé Drago Malefoy lors de son évasion du manoir des Malefoy, le pouvoir et la maîtrise de la baguette lui reviennent donc. Voldemort lance tout de même contre Harry le sortilège de la Mort, au moment même où Harry lui envoie le sortilège de Désarmement. La baguette de Sureau vole des mains de Voldemort, Harry la rattrape. Voldemort meurt alors de son propre sort renvoyé lors de sa collision avec le sort de Harry.
Épilogue (dix-neuf ans plus tard)
Ginny Weasley et Harry sont mariés et ont trois enfants appelés James de 12 ans (né en 2005), Albus Severus de 11 ans (né en 2006) (en l'honneur de Dumbledore et de Rogue, que Harry décrit à son fils comme l'homme le plus courageux qu'il ait jamais connu) et Lily de 9 ans (née en 2008) [1]. Ron et Hermione sont mariés également, et ont deux enfants appelés Rose, qui fait aussi sa rentrée, et Hugo, le plus jeune. Les deux familles se retrouvent à la gare de King’s Cross pour le départ du train de Poudlard. Lily est trop jeune pour y aller, alors qu’Albus entre en première année à l'école, et James est déjà à Gryffondor depuis deux ans. James embête Albus en disant qu'il ira à Serpentard au lieu de Gryffondor. Albus panique et Harry lui explique que ça n'a aucune importance. James découvre que Teddy Lupin, (baptisé du nom du père de Nymphadora, Ted Tonks), le fils de Lupin et Tonks, embrasse Victoire, qui est la fille de Bill et Fleur Weasley. Neville Londubat est maintenant professeur de botanique à l'école. À la gare, Harry, Ginny, Ron et Hermione aperçoivent Drago Malefoy de l’autre côté du quai avec son épouse et leur fils Scorpius; Malefoy leur fait un bref signe de tête.
Après le départ du train, Harry touche instinctivement sa cicatrice, qui ne l’a plus fait souffrir depuis 19 ans. Le livre se termine par « Tout était bien ».
